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Transcriptomic changes in bovine skeletal muscle cells after resveratrol trea...

作者:diyicizhuce | 时间:2022-7-19 21:52:07 | 阅读:178| 显示全部楼层
骨骼肌占细胞质量的很大一部分,这对牛的生长特征至关重要。白藜芦醇 (RSV) 是一种天然多酚化合物,参与肌肉的多效生物活动。因此,我们研究的目的是研究 RSV 对牛原代成肌细胞的转录组水平影响,以揭示差异表达基因 (DEG)。我们用含有 RSV 的 20 μM 母液处理了三个重复的原代成肌细胞,而没有 RSV 的其他三个重复用作对照组。然后,我们对两组进行了全基因组转录组分析。表达分析结果鉴定出3856个DEGs,其中1805个基因上调,2051个基因下调(调整后的P < 0.05)。此外,19 个选定 DEG 的 qRT-PCR 分析与转录组数据中观察到的表达水平一致。基因本体(GO)和通路富集分析分别显示 72 和 66 个显着的 GO 术语和 KEGG 通路(调整后的 P < 0.05)。最重要的 GO 术语是肌动蛋白细胞骨架组织 (GO:0030036)。最重要的 KEGG 途径是粘着斑(bta04510)。预测的蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 表明,编码细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂 1A 的 CDKN1A 连接了几个较大的蛋白质复合物。总之,我们的结果发现了一系列 DEG、重要的 GO 术语和途径,并在转录组水平上提供了对 RSV 对牛肌肉细胞影响的改进和扩展的理解。该研究阐明了使用富含介导白藜芦醇作用的途径的基因作为肉牛肌肉发育和生长的基因组选择靶标的潜力。

https://doi.org/10.1016/j.gene.2020.144849
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