Enrichr-KG: bridging enrichment analysis across multiple libraries

基因和蛋白质集富集分析是分析从组学实验收集的数据的关键步骤。 Enrichr 是一种流行的基因集富集分析网络服务器搜索引擎，包含数十万个带注释的基因集。 虽然 Enrichr 在为来自不同类别的许多基因集文库提供富集分析方面很有用，但整合跨文库和知识领域的富集结果可以进一步生成假设。 为此，Enrichr-KG 是一个知识图数据库和一个网络服务器应用程序，它结合了 Enrichr 的选定基因集库，用于综合富集分析和可视化。 富集结果显示为由节点和链接组成的子图，这些节点和链接将基因连接到它们的富集术语。 此外，Enrichr-KG 的用户可以向子图中添加基因-基因链接以及预测基因。 这种具有丰富和预测基因的跨库结果的图形表示可以阐明基因与来自跨数据集和资源的注释丰富术语之间隐藏的关联。 Enrichr-KG 目前提供来自不同类别的 26 个基因集库，包括转录、通路、本体、疾病/药物和细胞类型。 为了展示 Enrichr-KG 的效用，我们提供了几个案例研究。 Enrichr-KG 可在以下网址免费获得：https://maayanlab.cloud/enrichr-kg。

https://doi.org/10.1093/nar/gkad393