Backgroud:白藜芦醇 (RSV) 是一种酚类化合物,存在于许多人类膳食来源中,例如花生、花生酱、葡萄皮和葡萄酒。 RSV 因其对人类健康的益处而广为人知。来自牛骨骼肌的牛肉是人类食用蛋白质的主要来源之一。先前的研究还发现,猪肉和鸡肉的品质受饲料添加 RSV 的影响。此外,我们之前的研究使用信使 RNA (mRNA) 数据证明了 RSV 对牛成肌细胞分化的影响。在本研究中,我们主要关注 RSV 对 microRNA (miRNA) 表达的影响。
Method: 我们使用 20 μM RSV 处理原代牛成肌细胞并提取 RNA 用于 miRNA 测序。在对干净读数进行质量控制和比对后,我们对病例(RSV 处理)组与对照组(非 RSV 处理)组的差异表达 (DE) miRNA 进行了量化和分析。接下来,我们预测了 DE miRNA 的靶基因,并分析了它们的基因本体论 (GO) 术语和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 途径的富集。
Result:最终,我们确定了 93 个 DE miRNA(调整后的 P 值 < 0.05),其中 44 个上调,49 个下调。 Bta-miR-34c 是最显着上调的 miRNA。在计算机模拟中,预测结果表明 93 个 DE miRNA 有 1,869 个靶基因。 DE miRNA靶向基因的GO富集分析揭示了两个重要的GO术语(调整后的P值<0.05),其中最重要的一个是静纤毛(GO:0032420)。 KEGG富集分析显示5个显着通路,最显着的KEGG通路是胰岛素信号通路(bta04910)(调整后的P值<0.05)。
Conclusion:本研究通过 miRNA 调节提供了对 RSV 对原代牛成肌细胞分化影响的更好理解。结果表明RSV可通过刺激miRNA表达促进原代牛成肌细胞的分化。 DE miRNA的靶基因在胰岛素信号通路中显着富集,因此可能通过增加能量代谢来改善肌肉瘦度。
https://doi.org/10.29219/fnr.v65.5453 |