Genome-wide association study in Chinese Holstein cows reveal two candidate g...

背景
牛乳腺炎是一种典型的炎症性疾病，造成严重的经济损失。全基因组关联研究（GWAS）可以成为促进此类复杂疾病的标记辅助选择的有力方法。本研究旨在分析和鉴定与中国荷斯坦奶牛乳腺炎易感性状相关的单核苷酸多态性（SNP）和候选基因。

结果
48 个 SNP 与中国荷斯坦奶牛的乳腺炎抗性性状显着相关，主要位于 BTA 14 上。共有 41 个显着 SNP 与 31 个带注释的牛基因相关。基因本体和通路富集揭示了5个基因参与32条通路，其中TRAPPC9和ARHGAP39基因共同参与细胞分化和发育通路。六个常见的全基因组显着 SNP 位于 TRAPPC9 和侧翼 ARHGAP39 基因内。

结论
我们的数据确定了与 SCS EBV 显着相关的六个 SNP，这表明它们相关的两个基因（TRAPPC9 和 ARHGAP39）是荷斯坦奶牛乳腺炎易感性的新候选基因。

https://doi.org/10.1186/s12863-015-0263-3